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Vous trouverez ici différentes publications issues de mes traveaux de recherche. J'ai ajouté en plus quelques photos pour illustrer le travail effectué pour chaque étude.

Le site d'étude

Le site d'étude

Un mélange de litière au sol

Un mélange de litière au sol

Les invertébrés en milieu naturel

Les invertébrés en milieu naturel

Les litières avant analyse chimique

Les litières avant analyse chimique

Chambres climatiques de l'écotron

Chambres climatiques de l'écotron

Description d'un microcosme

Description d'un microcosme

Les mélanges de litières utilisés

Les mélanges de litières utilisés

Rotation des microcosmes

Rotation des microcosmes

Champignon dans un microcosme

Champignon dans un microcosme

Le sol apèrs lessivage

Le sol apèrs lessivage

Filtration des composés dissouts

Filtration des composés dissouts

Le tri des litières

Le tri des litières

Arrosage des microcosmes

Arrosage des microcosmes

La dissimilarité fonctionnelle à différent niveaux trophiques explique les processus du sol dans un système d'étude méditerranen exposé à deux régimes hydriques contrastés.

 

L’objectif de cette étude était d’étudier conjointement le rôle de la diversité des détritivores et de la diversité des litières sur une large gamme de processus du sol. L’hypothèse selon laquelle la dissimilarité fonctionnelle des détritivores et celle des litières interagit de manière positive a été testé grâce à une expérience en microcosmes mise en place à l’Ecotron européen de Montpellier.

Les résultats ont montré que l’identité des mélanges de litières et des communautés de détritivores a fortement influencée les processus étudiés. De plus, la dissimilarité fonctionnelle a influencé plusieurs processus clefs du fonctionnement des sols, son impact est modéré mais semble néanmoins pertinent pour comprendre l’impact de la diversité biologique sur les processus du sol.La diversité des litières et des détritivores a affecté de manière interactive seulement la perte de masse des litières. Cepedant, contrairement à notre hypothèse, cette interaction n’était pas synergique.

mathieu coulis
Comment un ver de terre endogé (Allolobophora chlorotica) modifie les formes de phosphore dans le sol ainsi que la croissance et les interactions entre le blé dur et le pois chiche en culture associée ?

 

De nombreuses expériences ont déjà été réalisées pour étudier l’effet des vers de terre sur la croissance d’une espèce de plante en culture pure. Cependant, des systèmes de culture innovants basés sur l’association de plusieurs espèces (souvent une légumineuse et une céréale) sont actuellement en développement pour répondre aux exigences environnementales. L’objectif de cette étude est donc de comprendre comment les vers de terre modifient la croissance des plantes lorsque plusieurs espèces sont cultivées en association. Puisque les légumineuses ont la capacité de fixer l’azote atmosphérique, notre étude s’est concentrée sur le phosphore qui est le nutriment susceptible d’être limitant dans ce type de culture.

La serre ou à eu lieu l'expérience

La serre ou à eu lieu l'expérience

Germination

Germination

Ce pot est un exemple de culture associée ou ont été semés du pois chiche et du blé . La photo a été prise en début d'expérience peut de temps après la germination.

Dispositif expérimental

Dispositif expérimental

Vue de dessus des pots contenant les différents traitements de l'expérience.

Dispositif expérimental

Dispositif expérimental

Vue d'ensemble.

Arrosage

Arrosage

Durant l'expérience, la teneur en eau du sol était ajustée régulièrement en pesant les pots et en ajoutant la quantité d'eau nécessaire pour atteindre 80 % de la capacité au champ.

Le bouton de la fleur de pois chiche

Le bouton de la fleur de pois chiche

Eclosion de la fleur de pois chiche

Eclosion de la fleur de pois chiche

Plantules de blé et de pois chiche

Plantules de blé et de pois chiche

Régulièrement au cours de l'expérience, des pots témoins étaient démontés pour suivre l'évolution de la biomasse aérienne et racinaire de chaque espèce.

Plantules de blé et de pois chiche

Plantules de blé et de pois chiche

Régulièrement au cours de l'expérience, des pots témoins étaient démontés pour suivre l'évolution de la biomasse aérienne et racinaire de chaque espèce.

Motte de terre avec vers de terre

Motte de terre avec vers de terre

A la fin de l'expérience nous avons pu constaté que les vers de terre avaient consommé et transformé en turricules une part importante du sol. Les racines ont ensuite colonisé ces zones de sol influencées par les vers de terre.

Motte de terre avec vers de terre

Motte de terre avec vers de terre

A la fin de l'expérience nous avons pu constaté que les vers de terre avaient consommé et transformé en turricules une part importante du sol. Les racines ont ensuite colonisé ces zones de sol influencées par les vers de terre.

Séchage des différentes organes

Séchage des différentes organes

Après avoir séparé le sol et les racines, les différents parties des plantes sont mises à sécher pour être pesées dans le but de connaitre leur biomasse.

Echantillons avant broyage

Echantillons avant broyage

Les parties aériennes et racinaires sont ensuite broyées au broyeur à bille pour pouvoir analyser leur teneur en Phosphore.

Echantillons après broyage

Echantillons après broyage

Les parties aériennes et racinaires sont ensuite broyées au broyeur à bille pour pouvoir analyser leur teneur en Phosphore.

Tubes pour analyse Phosphore

Tubes pour analyse Phosphore

Échantillons conditionnés pour les analyses de teneur en phosphore

Boulette fécale sur litière

Boulette fécale sur litière

Voici un exemple de boulette fécale de Diplopode naturellement déposée sur la litières. C'est ce mécanisme, pouvant agir comme un fertilisant pour les microorganismes, dont nous avons cherché à connaitre l'effet.

Exemple de microcosme

Exemple de microcosme

Au début de l'expérience, les individus ont été placés au centre du microcosme. Ensuite ils ont pu se déplacer librement pour choisir, les litières qu'ils préfèrent pour se nourrir.

Exemple de microcosme

Exemple de microcosme

Dans les microcosmes, les litières des 4 espèces étaient disposés dans des patchs différents. Les barrettes de séparation permettaient aux animaux de se déplacer librement tout en évitant que les litières ne se mélangent.

Mesures de SIR

Mesures de SIR

Multiplexeur utilisé pour mesurer la respiration potentielle dans 30 échantillons simultanément.

séparation_phase.png

séparation_phase.png

Migration sur colonne

Migration sur colonne

Cette étape de l'extraction des lipides membranaires permet de séparer les différents catégories de lipides pour ne récupérer que les phospholipides auxquels nous nous intéressons.

sepctro de masse.JPG

sepctro de masse.JPG

Lecture des échantillons Par le GSMS

Lecture des échantillons Par le GSMS

Sur l'écran chacun des pics représente un type de phospolipide.

mathieu coulis
Interactions entre microorganismes et macroarthropodes durant la dégradation des litières d'arbustes méditerranéens soumis à différents niveaux de disponibilité en eau.

 

Les organismes détritivores ont un effet direct important sur la décomposition de la matière organique en se nourrissant de feuilles mortes. Cependant leur rôle peut aussi être indirect en stimulant l’activité des microorganismes décomposeurs. En réalisant une étude en microcosme, nous avons essayé de mieux comprendre chacun de ces deux mécanismes (direct et indirect) par lesquels les détritivores participent au processus de décomposition.

Le premier objectif  de cette étude a pour but de tester si l’ajout de boulettes fécales fraiches sur des litières non ingérées peu accélérer leur décomposition en ayant un effet de « fertilisant » sur les décomposeurs microbiens. Le second objectif consiste à étudier l’effet d’une diminution de la disponibilité en eau sur le taux d’ingestion des litières par les détritivores.

mathieu coulis
Que deviennent les tannins condensés des litières après avoir été consommés par la faune du sol ?

 

Les tannins condensés sont des composés chimiques produits par les plantes que l’on retrouve dans les feuilles mortes des arbres (litières). Ces composés peuvent influencer le processus de décomposition car ils ont la propriété de se complexer avec d’autres molécules les rendant ainsi inaccessibles aux décomposeurs. L’objectif de cette étude est de mieux comprendre l’effet de la macrofaune du sol sur les tannins condensé en étudiant le devenir des tannins condensés des litières ingérées par différentes espèces de la macrofaune du sol.

Dentelle

Dentelle

Litière d'érable de Montpellier après avoir été mangée par des pomatias. Il ne reste que les nervures.

Glomeris marginata

Glomeris marginata

Voici un individus essayant de s'échapper lors de la collecte des animaux en début d'expérience.

Glomeris marginata

Glomeris marginata

Un individus sur des litières de chêne vert durant l'expérience.

Pomatias elegans

Pomatias elegans

Un individus sur des litières d'aulne durant l'expérience.

Un exemple de microcosme

Un exemple de microcosme

Ce microcosme correspond au traitement avec des glomeris et des litières de chêne vert.

Ramassage des boulettes fécales

Ramassage des boulettes fécales

Les boulettes fécales étaient ramassées et séchées chaque jour et pour éviter qu'elles ne subissent une dégradation microbienne trop importante.

Consommation

Consommation

Un exemple de litière de chêne vert partiellement mangée par des glomeris.

Consommation

Consommation

Un exemple de litière de chêne vert partiellement mangée par des pomatias.

Boulettes fécales

Boulettes fécales

Les boulettes fécales des glomeris (à gauche) sont beaucoup plus grosse que celles des pomatias (à droite). On distingue encore des fragments de litières dans les boulettes de glomeris.

Extraits de litières

Extraits de litières

Ces échantillons sont élaborés à partir de litières broyées. Ils sont ensuite utilisés pour effectuer le dosages des tannins condensés.

Balance de précision

Balance de précision

Cette balance précise à 0.0001g permet de peser de petite quantité de litière finement broyée afin de doser la teneur en azote (N) et en carbone (C).

Analyses chimiques

Analyses chimiques

Le test au butanol-HCl, permet de doser les tannins condensés dans un extrait. Suite à l'ajout d'un réactif ferrique qui donne une couleur jaune. les échantillons sont ensuite chauffé et se colorent en rose.

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mathieu coulis

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